3月17日，大量民眾自西方國家返回臺灣，境外移入的案例陸續增加[64]，防疫工作與人力上的壓力陡增[65]。 3月10日，在歷經先前包機風波後，第二批載有361名臺灣人的兩架包機從武漢市返回臺灣，並進行隔離檢疫[60][61]。 12月31日，疾管署得知網路正在討論武漢疫情的貼文後，基於先前防疫經驗並高度重視，且向中國疾病預防控制中心及世衛確認訊息[18][19]。 由行政院副院長陳其邁召開跨部會應變整備會議，疾管署緊急召開公布[20]。 指揮中心指出，近期確診個案解隔離情形，5月11日至6月13日累計公布11,722位確診個案中，已有6,188人解除隔離，解隔離人數達確診人數52.8%。 指揮中心說明，今日新增8例死亡個案，共計為男性3位、女性5位，年齡介於50多歲至90多歲，發病日介於5月15日至6月2日，確診日介於5月17日至6月8日，死亡日介於6月6日至6月12日，詳如新聞稿附件。
舉凡司機、旅館從業人員出現類似症狀都要檢驗，醫事人員更是連「咳一下也檢驗」。 台灣的作法其實就是在做普篩，但是針對有一點點風險症狀者採檢，至今做了至少上萬例不符合通報病例者採檢，還是沒有找到潛伏感染者。 高雄市部分基層醫護亦反對此事，並由台灣醫事行動聯盟發起連署，6小時內已有2千580名醫護人員連署反對。 此外，由防疫、公衛及感控人員組成的專業團隊來評估封城演練的必要性及施行細節，不要為了博取鎂光燈而勞師動眾，浪費更多資源和行政人員的時間。
台灣疫情指揮中心: 疫情升溫！各縣市上班政策總整理（不斷更新）
尚未接種基礎劑第1劑者，自4月2日以後，請接種「Moderna」（單價疫苗），接種單位於4月2日以後將不再提供(含預約作業)第1劑接種「Pfizer/BioNTech疫苗」；三、滿「12歲至未滿18歲」（青少年）兩劑基礎劑需間隔12週以上以同製程疫苗接種。 自即日起未曾接種基礎劑第1劑者，請接種「Novavax疫苗」，接種單位將不再提供(含預約作業)青少年第1劑接種「BioNTech疫苗」；四、「18歲以上」（成人）如預定以同廠牌完成接種，第1劑「BioNTech疫苗」必須於2月21日以前接種。 如於2月22日以後接種第1劑(可擇定「BioNTech」或「Novavax」COVID-19疫苗)，但後續第2劑請以「Novavax疫苗」銜接接種[227]。 9月18日，指揮中心宣布，考量目前國內口罩產量已大幅提升，足夠供應每位國人所需，且有多元購買口罩管道，民眾透過實名制通路取得口罩的需求已大幅下降，因此「口罩實名制」網路/超商販售通路，將運作至第44輪後暫停服務。 藥局通路及無健保特約藥局的偏鄉衛生所，則仍持續維持實名制口罩販售服務[119]。
中央流行疫情指揮中心今(7)日宣布，4月10日零時起(航班抵臺時間)，旅客如過去14日內具英國、南非共和國或史瓦帝尼王國等國家旅遊史(含在當地轉機)，入境後恢復自第三級流行地區抵臺旅客之檢疫措施(防疫旅宿或1人1戶居家檢疫14天)，無須再入住集中檢疫所，後續仍應落實7天自主健康管理。 台灣疫情指揮中心2023 中央流行疫情指揮中心今(21)日表示，今(2021)年5月17日考量國內及國際COVID-19疫情升溫，宣布自5月19日開始，暫停未持居留證之非本國籍人士入境，因此教育部配合指揮中心邊境嚴管措施，暫停境外學生入境申請作業。 現經評估國內疫情趨緩，且110學年度開學在即，教育部專案簽請指揮中心8月20日同意，重新開放110學年度境外學位生及華語受獎生等申請入境。
台灣疫情指揮中心: 外交部配合開放邊境管制措施調整外籍人士來臺規範
由於最初徵用25家口罩大廠每天僅生產320萬副口罩，行政院同意經濟部新增產線提供產量的構想[281]。 中華民國衛生福利部稱，自發現疫情至今，國家衛生指揮中心中央流行疫情指揮中心始終抱持著資訊公開透明的態度，為民眾提供即時的疫情訊息及正確的防疫觀念[239]。 為了讓民眾信賴政府並願意配合防疫措施，中央流行疫情指揮中心的團隊成員連續每天下午2時直播舉行疫情記者會，早期階段還曾一天召開三次[240]。 其中疫情記者會由陳時中親自說明，時長大約一個小時，並有手語翻譯員即時提供手語服務[241][242]。 許多民眾每天下午2時收看中央流行疫情指揮中心的記者會，形成共同參與防疫的社會氛圍[243]。 臺灣連續44天沒有本土病例確診後，中央流行疫情指揮中心一度改為每週三召開記者會[244][242]。
國家衛生指揮中心成功與否，除需要靠科技設備完善的環境與各種緊急醫療相關資訊的整合外，還必須有完整的指揮體系規劃。 中心運作以美國緊急應變通用的指揮架構 (Incident Command System) 為基礎，並參考 SARS 應變經驗，完成標準作業程序，作為未來國家衛生指揮中心運作之依據。 2022年6月中，指揮官陳時中、社區防疫組組長薛瑞元、醫療應變組組長王必勝與發言人莊人祥陸續確診嚴重特殊傳染性肺炎。 指揮中心統計，今年1月至9月24日，本土輕症、無症狀個案累計613萬5676例、占99.56%，中症累計1萬5506例、占0.25%，重症累計1萬1685例、占0.19%，其中死亡累計9974人。 社區感染疫情，普篩聲浪再起，陳時中表示，如今普篩只會讓情形更亂，但擴大篩檢確實必要，需要擴大區隔，積極採檢，現在要全體動員，如檢討華航諾富特案或社區感染擴散件事等，「不必要批評已經無意義」，應全體民眾齊心積極抗議，疫情已經非常嚴峻，這不是開玩笑的。
台灣疫情指揮中心: 口罩管制
二、前述7國旅遊史以外之所有入境旅客，入境後應入住防疫旅宿或自費入住集中檢疫所14天，且於居家檢疫期滿前配合進行PCR檢測。 三、國籍航空公司機組員，自「重點高風險國家」航線航班返臺後，應居家檢疫14天及檢疫期滿進行PCR檢測，且應入住防疫旅宿或符合規定之公司宿舍。 配合中央流行疫情指揮中心公告，外交部自本（2022）年9月12日起恢復實施美國、加拿大、紐西蘭、澳洲、歐洲與邦交國國民得以免簽證方式入境，從事商務、參展、考察、國際交流、探親、觀光、社會訪問等無須申請許可的活動。 2020年3月，有些政治人物和學者開始擔憂部份防疫政策過度侵犯人權、且部份行政命令沒有法源依據；「防疫視同作戰」的口號造成各種嚴厲手段無限上綱[455][456]。 台灣人權促進會指出口罩實名制違反《全民健康保險法》、徵用超商和藥局配售口罩違反《傳染病防治法》[457]。 原先以國內防疫為由強制向廠商徵收口罩，在四月卻開始捐給外國做口罩外交的做法也引起學者質疑[458]。
問題3： 已經有外僑居留證的外籍人士，如果過去14天內曾經入境或居住於中國大陸、香港或澳門，還可以返回臺灣嗎？ 但目前中國大陸及港澳地區均為「二級以上流行地區」，只要過去14天內曾經入境或居住於陸、港、澳地區者，入境後必須遵守中央流行疫情指揮中心公布的「具感染風險民眾追蹤管理機制」，配合「居家檢疫」14天。 指揮中心指出，為確保國內防疫安全，所有入境旅客均應出示「表定航班時間(Flight schedule time)前3日內COVID-19核酸檢驗報告」後搭機來臺；入境臺灣旅客應事前安排檢疫居所(防疫旅宿或1人1戶居家檢疫)，且須於「入境檢疫系統」完成線上健康申報並切結符合相關規定。
台灣疫情指揮中心: 【最新】台灣連5天本土個案破百 全國進入三級警戒！
二、指揮中心已訂定相關監督機制，並由衛生福利部疾病管制署及地方政府衛生主管機關執行，隨機抽查各縣市已核定縮短居家檢疫者之相關行程活動，且邀請公司或單位及受邀商務人士應配合相關訪查作業。 指揮中心表示，自印度入境旅客不需支付集中檢疫場所費用，請旅客誠實申報14天內健康狀況及旅遊史，以確保自身健康，共同維護國內防疫安全。 勞動部於本（2）月7日公告，經報中央流行疫情指揮中心確認越南及菲律賓等國均已配合相關防疫措施，將自2月15日起開放越南及菲律賓籍移工入境。 指揮中心再次強調，邊境檢疫措施為防範COVID-19疫情的重要關鍵，請民眾務必遵守檢疫期間相關事項，共同維護國內社區安全。 指揮中心重申，邊境檢疫措施為防範COVID-19疫情的重要關鍵，籲請民眾務必遵守檢疫期間相關事項，共同維護國內社區安全。
- 五大電信紛紛宣布於萬華區、蘆洲區的部份實體門市，即日起啟動防疫升級，並有多家門市均暫停營業至5月28日；正常營業的門市，民眾進入需落實戴口罩與量額溫等防疫措施，並採行實名制登記與控管人流。
- 他指出，目前已掌握案1217在發病前幾天曾參加南部進香團，已掌握遊覽車同車人員，並通知相關單位釐清其足跡。
- 蘇世斌也再次呼籲，雨後一定要巡視家戶內外環境，儘快將積水清除；第一線醫護人員則應加強通報警覺，如發現民眾有不明原因發燒或疑似症狀，且有登革熱流行區域活動史時，請進行登革熱NS1快篩輔助診斷，以利及早發現隱藏個案，避免疫情持續於社區中擴散。
- 由於最初徵用25家口罩大廠每天僅生產320萬副口罩，行政院同意經濟部新增產線提供產量的構想[281]。
- 雙和醫院16日公告，暫停民眾接駁車服務，並且建議民眾非必要勿前來就診，若是有慢性處方箋者，還是能夠前來領藥。
- 三級警戒是指單週出現 3 件以上的社區群聚，或單日出現 10 名感染源不明的本土病例，中央流行疫情指揮中心可能會將警戒等級升至第三級防疫。
- 王必勝表示，確診者同住家人11月7日起不論是否有完成接種疫苗追加劑，統統改為「0+7」，不需居家隔離。
因應國際武漢肺炎疫情發展，指揮中心目前已將中國大陸(含港澳)、韓國、義大利列旅遊疫情建議列第三級警告；日本、新加坡、伊朗列第二級警示；泰國列第一級注意。 因應國際武漢肺炎疫情發展，指揮中心目前已將中國大陸(含港澳)、韓國、義大利、伊朗列為旅遊疫情建議第三級警告；日本、新加坡列第二級警示；泰國列第一級注意。 台灣疫情指揮中心 指揮中心提醒，國人應避免至上述國家及地區進行所有非必要旅遊；另於台灣時間3月17日16時起，已登機者加強自主健康管理14天，尚未登機者入境後需居家檢疫14天。 配合中央流行疫情指揮中心防疫措施，本部前已宣布自3月19日零時起，來臺的非本國籍人士，除持居留證、外交公務證明、商務履約證明，或其他經特別許可者外，一律限制其入境。
台灣疫情指揮中心: 防疫評價
答案： 外交部宣布的措施是因應「武漢肺炎(COVID-19)」疫情持續擴大。 符合特定條件的非本國籍人士應備妥相關文件，由移民署國境線上查驗人員認定是否准予入境。 另持有駐外館處核發特別入境許可者，或是有效居留證（官員證），可逕由移民署查驗後入境。 中央流行疫情指揮中心今(25)日表示，國際COVID-19疫情嚴峻，加上聖誕節、寒假、春節將至，預期返臺旅客數增加。 為確保同班機旅客、機組員及國內社區的防疫安全，自今(2020)年12月1日起實施秋冬防疫專案，請來臺旅客登機前配合出示3日內COVID-19核酸檢驗報告。 此外，因應英國報告病毒變異株疫情，歐洲多國、香港、加拿大等逾40個國家已對英國採取禁航等限制措施。
2.需有 2 台灣疫情指揮中心 日內家用抗原快篩陰性檢驗結果，才可外出工作及採買生活必需品。 5.上班期間全程佩戴口罩，維持社交距離，有飲食需求時可暫免佩戴口罩，並於用畢立即佩戴口罩 。 7.商務履約得於餐廳之獨立空間內獨自或與特定對象共餐，但應有隔板或維持社交距離。
台灣疫情指揮中心: 配合中央流行疫情指揮中心自5月19日至6月18日暫緩未持有我國有效居留證的外籍人士入境，外交部將暫停受理各類簽證申請
中央流行疫情指揮中心李秉穎專家諮詢小組委員提出，普篩的用意是當對於一個社區病毒流行情況不了解下，需要廣泛性的檢查，以免病毒再擴散出去，但是台灣不需要，因為連續47天無本土病例零確診，可說是全世界第一。 現在防疫重點是要防堵來源是境外移外可能病毒，而不是去找本地根本不存在的病毒。 核酸檢驗比較貴、比較費時，而抗體與抗原檢驗有準確性的一些缺點…這樣反而會造成困擾，在社區並無任何病毒存在情況下做此檢測，其中會有一些人是陽性，接著要做接觸者追跡與調查，結果可能是偽陽性。 （台灣英文新聞 /林于雯 綜合報導）指揮中心公布，國內今（15日）新增4萬3478例新冠肺炎本土個案及32例境外移入；另確診個案中新增77例死亡。 今天也恰逢疫情指揮中心成立第1000日，蔡總統在記者會上指出國際肯定台灣防疫成績，須歸功於台灣防疫人員以及國民，並強調台灣正在疫情中持續進步。 為因應世界各國針對「武漢肺炎(COVID-19)」分別採取國境及飛航限制，外交部宣布：2020年3月21日（含）以前，以免簽證、落地簽證或持停留簽證入境我國，且停留期限尚未逾期之外籍人士，其在臺得停留期限，一律自動延長30日，毋需另行申請。
中央流行疫情指揮中心今(27)日表示，義大利近期COVID-19(武漢肺炎)病例數及死亡病例快速增加，鑒於國人至當地感染的風險提高，指揮中心宣布今日起提升義大利旅遊疫情建議至第三級：警告(Warning)，提醒民眾非必要勿前往。 此外，指揮中心亦同時宣布，自台灣時間2月28日零時起，所有旅客（包含外籍人士）自義大利入境（轉機除外），需進行14天居家檢疫。 長榮航空一名紐西蘭籍機師（案765）確診新冠肺炎，然而他早已出現咳嗽症狀卻不戴口罩，甚至在自主健康管理期間密切接觸女性友人（案771），違規進出百貨公司、大賣場、車站等公共場所。 屢次違反防疫規定，造成2名同事及1名友人感染，也讓台灣零本土案例紀錄在253天止步。 針對該機師不當行為，長榮航空於2020年12月23日因其違反相關防疫規定及傳染病防治法，並造成公司商譽受損，將其即日免職[145]。 中央流行疫情指揮中心針對國籍航空機組員染疫事件，經與航空公司共同檢視現行公布的「國籍航空公司實施機組人員防疫健康管控措施作業原則」，發現機組員在機艙內及外站管理上尚有待加強之處，要求民航局及航空公司研議如何強化現有航空檢疫措施[146]。
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臺灣各地6,000多家特約藥局藥師及衛生所協助發放口罩[289]，物流則由中華郵政負責[286][290]。 為了改善口罩分配不均的問題，政府先後透過「健康存摺」推出「口罩實名制2.0」和「口罩實名制3.0」，增加網際網路預購等通路[291]。 隨著臺灣防疫限制鬆綁，只適度地開放低風險國家和商務往來，並允許持有「就業金卡」的高技能工作人員入境[262][263]。
2020年1月20日，因應國際已有多起嚴重特殊傳染性肺炎案例，國家衛生指揮中心針對該疾病開設「嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心」，由疾管署署長周志浩擔任指揮官。 1月23日，行政院將該指揮中心提升為二級開設，指揮官改由時任衛生福利部部長陳時中擔任，副指揮官由時任內政部政務次長陳宗彥擔任。 2月27日，行政院將該指揮中心再提升為一級開設[1]，指揮官繼續由時任衛生福利部部長陳時中擔任。 （台灣英文新聞/生活組 綜合報導）中央流行疫情指揮中心今(12)日公布國內一口氣新增16例本土及1例調查中COVID-19確定病例，皆為本國籍。
台灣疫情指揮中心: 【武肺統計】台灣北市單月1170人確診•萬華659例成「感染熱區」 失聯染疫者多達146人?! 北市府澄清: 是78人
中央流行疫情指揮中心今(4)日表示，我國今(2020)年9月24日起實施自菲律賓入境旅客皆於集中檢疫場所完成檢疫，並於檢疫期滿前再進行採檢之措施。 截至11月3日，已採集1,294位旅客檢體，其中1,268位無症狀者，有9名於檢疫期滿前採檢後確診。 指揮中心指出，亦將加強入境者之居家檢疫措施，自明年1月15日零時起，入境旅客除須依原規定檢附登機前3日內檢驗報告外，亦須提供檢疫居所證明(以集中檢疫或防疫旅宿為原則，若選擇居家檢疫者，則須1人1戶且經切結)。 外籍人士如果因奔喪、探視病危親屬等緊急重大事由急需來台，必須經指揮中心專案許可後才能向駐外館處申請特別入境許可簽證。 一、「重點高風險國家」入境旅客(過去14天旅遊史、含轉機)之檢疫措施：自空港或海港入境後一律入住集中檢疫所14天，且須配合入住時、檢疫期滿進行PCR檢測，旅客不需支付檢疫所及採檢費用。 目前「重點高風險國家」為巴西(巴西變異株)、印度，含本次新增英國、秘魯、以色列、印尼及孟加拉等共7國。
自2020年1月起，至2023年3月20日止，臺灣在嚴重特殊傳染性肺炎疫情中的累計確診個案有10,236,886人，累計死亡個案則有18,803人（病死率0.18%）。 當中分別有10,178,478例本土個案（約佔99.4%）、58,354例境外移入個案（約佔0.6%），另有54例個案被歸類為其他狀況（36例敦睦遠航訓練支隊個案、3例航空器個案、1例不明個案及14例調查中個案）[551]。 2019年底至2020年初，傳出疫情之初，有人大量購買口罩希望捐給武漢，然而敵視中國大陸者否定此行為、認為口罩應留在台灣使用[449]。 中華民國政府在2020年1月禁止口罩出口[450]，引起網友、政治人物和演藝明星多方爭論[451][452][453][454]。 為了避免大量病患湧入癱瘓醫療體系，衛生福利部規劃四階段醫療整備及應變策略，並以監測系統協助重要決策[319]。 其中在疫情升高後，醫療院所會實行分艙分流、輕重分級制度[102]，將醫療資源留給重症患者（英語：Impact of 台灣疫情指揮中心 the COVID-19 pandemic on ICU 台灣疫情指揮中心 capacity）[320]。
台灣疫情指揮中心: 健康網》 登革熱持續延燒！ 中醫師揭蚊子最愛「這2種」體質
外交部針對受武漢肺炎（COVID-19）疫情影響而滯留我國的外籍人士，已分別在本（2020）年3月21日、4月17日及5月18日3次宣布延長在臺合法停留期間30天的措施。 指揮中心指出，境外檢驗的目的，在於讓航空公司於旅客登機前可瞭解旅客個人健康狀況，並依據旅客防疫風險，於機上採取適當預防措施，降低傳播風險。 此外，如入境後才採檢，亦可能造成大批旅客在機場滯留等待採檢，增加感染機會。
目前全世界還沒有國家進行全面性的普篩，韓國之所以採檢個案這麼多，主因仍是韓國確診個案多，「隨便篩隨便有」，而台灣每天檢驗量約為110例上下，但近期並沒有社區的個案，因此通報的個案數也隨之減少。 對於外界質疑台灣採檢量過低，莊人祥回應，台灣每驗到1例確診病例，通常會額外再驗160、170例，以這樣的檢驗量已算相當多。 中央流行疫情指揮中心今(1)日表示，伊朗近期COVID-19(武漢肺炎)病例數及死亡病例快速增加，鑒於國人至當地感染的風險提高，指揮中心宣布今日起提升伊朗旅遊疫情建議至第三級：警告(Warning)，提醒民眾非必要勿前往。 此外，指揮中心亦同時宣布，自台灣時間3月2日零時起，14天內有該國旅遊史者(不含轉機)，入境後需居家檢疫14天。 中央流行疫情指揮中心今(22)日表示，我國長期推動國際醫療服務，不但協助各國來台就醫的病人，並屢受國際媒體報導，藉此也深化國際友誼。
