7月16日，台灣人之2歲(含)以下持居留證的中國大陸籍子女申請入境，並得由父母親陪同，入境後須依規定完成14天居家檢疫[228]。 6月29日，外籍人士除觀光、一般社會訪問以外，得提出申請入境；港澳人士有特殊人道考量、緊急協處、商務履約、跨國企業內部調動及商務經貿交流(含工作居留、投資居留及創新創業居留等)之需求，或已取得居留證之外籍配偶、子女，得提出申請入境。 但仍應主動出示「表訂登機時間前3天內之COVID-19核酸檢驗陰性報告(英文版)」，並配合入境後居家檢疫14天及必要之檢疫措施[224]。 5月10日，台灣超過28天（2個14日潛伏期）沒有本土病例，以公衛立場來看屬於相當安全的社區[189]。 5月8日，原先為了防疫而不開放民眾進場之中華職棒例行賽，每場比賽將開放1000名觀眾進場觀賽。
另外政府還準備社區採檢網路，得啟動「加強社區監測方案」完善社區監測網路及分級收治，針對高風險對象加強採檢[336]。 在疫苗接種部分，臺灣將優先建議接種疫苗的族群分為九類，涵蓋臺灣人口的60%[337]。 感染科醫師和隔離病房醫護人員便直接面對確診個案，前者往往還負責監控最新訊息及進行教育訓練[327]。 因應醫護人員需求大增，中央流行疫情指揮中心有條件限制出境（英語：Impact of the COVID-19 pandemic on healthcare workers）[329]，醫事司亦規劃降載計劃[330]。
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根據中央流行疫情指揮中心的數據模擬，戴上口罩或保持社交距離能避免醫療體系崩壞[315]。 若到了第四級疫情警戒，則進入非必要不得外出（英语：Cocooning (behaviour)）、全面停班停課、指定區域封鎖（英语：COVID-19 lockdowns）的階段[95]。 中華民國衛生福利部称，自发现疫情至今，國家衛生指揮中心中央流行疫情指揮中心始终抱持著資訊公開透明的態度，為民眾提供即時的疫情消息及正確的防疫觀念[239]。
未來將由「確診均通報」改為「併發症（中重症）才須通報」，即如為新冠檢驗陽性，且出現肺炎需氧氣治療或其他新冠相關併發症，因而住院（含急診待床）或死亡，醫事人員才須通報。 指揮中心指出，過去為強化民眾接種新冠疫苗的意願、擴大防疫效果，因此才依據《災害防救法》訂定「疫苗接種假」的相關辦法，從防疫控制面而言，疫苗接種假發揮相當大的功能。 而在完成階段性任務後，未來降級後的COVID-19將比照流感疫苗的接種辦法，回歸一般性規定辦理。 由於快篩試劑自實名制政策實施以來已賣出約1,505萬餘份（共7,525萬劑），近期的購買量已由最初的單日25萬餘份下降至千餘份，此外自由市場供應充足、民眾於「防疫新生活」的「輕症免隔離」政策下，降低購買需求，因此定案實名製將實施至民國112年的4月30日止。 指揮中心指出，目前國內防疫物資與藥品仍維持一定數量，據統計家用快篩庫存6079萬劑、醫用口罩2.76億片、N95口罩961.4萬片、隔離衣240萬件。
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此外，民眾入境填寫檢疫通知書資料若不確實(包括提供不實聯絡資料或漏填)，除不得領取防疫補償金，將依「傳染病防治法」最高處15萬元罰鍰，另違反相關檢疫規定者，依法罰10至100萬，並公布其姓名[133]。 自旅遊疫情建議第三級以外國家、地區入台短期停留之外來人士無健保卡者，於入境後發病，除需自付門急診醫療費用外，也需自付檢驗費用[134]。 因近期台灣境外移入個案數攀升，將往回追溯3月3日至14日期間所有自歐洲入境者，並針對其中可能之對象進行檢驗[135]。 臺灣醫療體系自此重視感染管制措施，將院內感染管制列為例行醫院評鑑中的查核項目[10]。 醫界配合建立完善的傳染病監測系統，並擴充疾病管制署、中央實驗室和合約實驗室的檢驗能量[11]。
歐盟數位新冠證明為世界性標準之一，國際成員國多且最早用於國際旅行，為使台湾民眾能加速入境歐盟等國家，將於12月28日上午8時開放台湾「數位新冠病毒健康證明」供國人下載使用[144]。 2月27日，中央及台北市流行疫情指揮中心提升為一級開設，由陳時中擔任指揮官[105]。 同時，將義大利的旅遊疫情警示升為第三級（三級 不宜前往），自2月28日零時起，14天內有義大利旅遊史者，入境後需進行14天的居家檢疫[106]。
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政府還設置27處集中檢疫所，可收容無需積極治療的輕症患者[102]，同時有大量防疫旅館集中在直轄市[98][308]。 2月3日，教育部部長潘文忠表示，為了防止武漢肺炎疫情擴散，大專院校統一延後到2月25日以後開學，中國大陸學生2月9日後維持暫緩赴台，但學期仍要維持18週，高中（含）以下學校延後開學，由原訂開學日之2月11日，更動為2月25日開學，且將暑假延後至7月15日[50]。 針對國中會考、統測等考試日程和入學措施時程則不變，因應開學時間延後和課程實施調整，會請相關考試單位調整考試範圍[52]。 針對研究所入學考試事宜，各校以不影響學校考試和考生的準備，依原計畫進行，但辦理入學考試事務時須依照，進行高規格防疫措施[53]。 疫情什麼時候趨緩 同日蘇貞昌院長宣布口罩購買政策，2月4日起四大超商停止販售口罩，並自2月6日起購買口罩採實名制，民眾需使用健保卡在全台六千多家健保特約藥局或衛生所（偏鄉地區）購買，每個人在7天內限購2片，一人可持兩張健保卡，一片降價為5元[54]。 晚間，首批撤僑專機有247人搭乘中國東方航空抵達台灣，再由專車載至新北市及台中市等檢疫所[55]。
另外，自2月27日起，兒童健保卡不受身分證字號尾數單雙號分流限制，每日都可購買，且最多一次可持三張兒童健保卡購買口罩[102]。 1月24日，因應新增兩例確診新冠肺炎，旅遊警示再次提升，預備至中國大陸旅遊之旅遊團，全面停止出團。 原居住地在武漢的入境限制改擴大為湖北省地區（因當地部分地區已陸續封城）不准登機或入境[38]。 疫情指揮中心指揮官陳時中今（6）日宣布有本土確診36168例，境外移入45例，總共36213例確診（包含10例死亡）。 此後臺灣仍與嚴重特殊傳染性肺炎疫苗全球取得共享機制COVAX簽約，確保臺灣能分配到476萬劑疫苗[490][491]。 除了加入COVAX計劃外，臺灣還另外分別購買1,000萬劑牛津－阿斯特捷利康嚴重特殊傳染性肺炎疫苗、以及505萬劑莫德納嚴重特殊傳染性肺炎疫苗[490]。
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其中新設中央指揮體系的「國家衛生指揮中心」、及透過法制程序授權成立下屬的「中央流行疫情指揮中心」，統整資源、設備、人力來讓防疫決策一致化[6]。 3月19日，中央流行疫情指揮中心將亞洲十九國、東歐一國、北美洲兩國及大洋洲十六國[註 9]的旅遊疫情警示升為第三級（三級 不宜前往）。 不論從何處返台，所有境外返台者，都需填寫「入境健康聲明暨居家檢疫通知書」，並配合居家檢疫14天（禁止外出，配合流行地區分級處理）[137]。 外籍人士除持有外交、商務相關文件或特殊文件人士與持有中華民國居留證者，一律禁止入境，入境者也須配合居家檢疫[138]。
2月23日，中央流行疫情指揮中心將伊朗及義大利的旅遊疫情警示升為第一級（一級 一般措施）[96]。 鑽石公主號上的中華民國籍19人（扣除隨行醫師）2次採檢結果均為陰性，將送至檢疫所隔離檢疫14天[97]。 衛生福利部於今日比照其他傳染病，公布嚴重特殊傳染性肺炎的地理分布統計資料[98]。 2月11日，中央流行疫情指揮中心宣佈針對疫情狀況調整為港澳（三級 避免前往）、新加坡（二級 加強防護）、泰國（一級 注意防護）[70]。
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國家衛生研究院、中央研究院、國光生技、高端疫苗生物製劑、聯亞生技開發等也分別研發疫苗[347][348][349]，並採取快速審查（英語：Rapid reviews）機制[350]。 為了加速相關研發所需的法規審查，食品藥物管理署則建立專責輔導團隊，並製備病毒標準品提供給相關機構[351]。 檢疫人員全面加強發燒篩檢和健康評估，所有旅客入境前需填寫「旅客入境健康聲明暨居家檢疫電子化系統」資料，有症狀者（英語：Symptoms of COVID-19）接受採檢、並送集中檢疫所等待結果[259]。 旅客資料並整合至14天居家關懷及追蹤告警的「防疫追蹤系統」，進行後續社區追蹤關懷[260]。
- 同日，全國醫院與長照機構，自即日起至6月8日止（共計4週），除例外情形，停止開放探病及探視，住院病人之陪病者及長照機構住民陪伴者仍為1人[36]。
- 中華民國政府在2020年1月禁止口罩出口[450]，引起網民、政治人物和演藝明星多方爭論[451][452][453][454]。
- 2月12日，由於新加坡、日本出現「無旅遊史確診」個案，中央流行疫情指揮中心決議以回溯方式對留存檢體追加檢驗。
- 在中華民國政府禁止出口口罩後[546]，由於疫情持續蔓延、大陸配偶子女入境、滯留人員接返等問題，海峽兩岸民間因彼此不同的立場陷入爭論，分歧與對立日益擴大[547][548]。
社會工作者則為遊民等弱勢族群進行訪視關懷、提供防疫物資與衛生教育宣導，並到社區及相關社會福利機構服務[430]。 隨著疫情趨緩，社會工作者則依規定審核補償和紓困金並撥付給民眾，並針對生活困苦的家庭提供關懷輔導服務[431]。 而在疫情期間，隨著臺灣的「合法移工」人數下降、「非法移工」人數持續上升，許多僱用「家務移工」照顧長輩的雙薪白領家庭受到影響[432]。 相對於醫院內部照顧員和看護不願接案，許多家屬則必須自己輪班進入醫院陪病[433]。
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中央流行疫情指揮中心則發起「護臺灣，助世界」的口罩人道援助活動，民間企業亦有捐贈行動（英语：Charitable activities related to the COVID-19 pandemic）[501]。 根據統計，臺灣共捐贈超過5,000萬枚口罩、131臺熱像儀、35,000支額溫槍、250組體溫量測系統等相關醫療設備[502]。 2020年3月，有些政治人物和學者開始擔憂部份防疫政策過度侵犯人權、且部份行政命令沒有法源依據；「防疫視同作戰」的口號造成各種嚴厲手段無限上綱[455][456]。
各地區應變醫院則透過過往經驗及整備表單，迅速自我檢查及整備完成（英语：Impact of the COVID-19 pandemic on hospitals）[325]。 10月3日，開放醫事人員、機場港埠、居家檢疫相關工作人員及航空機組員/船員、機構與社福照護系統相關工作人員、50至64歲成人、18歲以上因外交、公務、洽商等工作需求需出國者接種莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.1變異株）。 5月26日，正式實施修訂「2019年冠狀病毒病」定義，民眾使用家用抗原快篩試劑檢測結果陽性，不分年齡及族群，經醫事人員確認，或由醫事人員執行抗原快篩結果陽性者，即可研判為確定病例[190]。 疫情什麼時候趨緩2023 5月18日，正式實施修訂「2019年冠狀病毒病」定義，65歲(含)以上且非居家隔離、自主防疫、居家檢疫者，使用家用抗原快篩試劑檢測結果陽性，經醫事人員確認，或由醫事人員執行抗原快篩結果陽性者，即可研判為確定病例[188]。 衛福部食藥署召開專家會議，核准輝瑞-BNT疫苗用於5至11歲兒童的基礎接種[179]。 3月24日，「衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組」（ACIP）召開專家會議，決議「12至17歲」（青少年）的「基礎劑」可打「莫德納疫苗」，也可混打「BNT疫苗」，但1、2劑「間隔12週」，醫療院所應充分告知接種「莫德納」保護力，及心肌炎、心包膜炎風險，並經家長同意、醫師評估後才可接種[168]。
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隨著車用晶片等因疫情出現缺貨潮後[405]，台灣積體電路製造等晶圓代工業者受到關注[406][407][408][409][410]。 5月12日，台灣新增16例本土個案以及1例調查中COVID-19確定個案，本土確診個案創單日新高[37]。 （一）.國際醫療病患可透過醫療機構檢具相關資料、文件向衛生福利部提出申請（除健康檢查、美容醫學等非急迫性醫療需求外），該部將依其醫療必要性、療程延續性及風險性等原則進行審查許可，協助海外人士來臺接受必要的醫療服務[23]。 而在口罩業者推出多款口罩後，帶動防疫物資成為時尚產業（英语：Impact of the COVID-19 pandemic on the music industry）的風潮[398]。 到了2020年6月，零售業（英语：Impact of the COVID-19 pandemic on retail）及餐飲業表現也有所回升[399]、失業率下降[400][401][402]。 2021年5月19日，因應本土疫情升高，臺灣再度暫緩未持有中華民國居留證的外籍人士入境，並暫停旅客前來臺灣轉機[266]。
中央流行疫情指揮中心指出，由於國內外疫情趨緩，因此如疫情持續保持穩定，將於2023年的3月20日（個案採檢日）起調整「嚴重特殊傳染性肺炎」疾病通報定義。 陳秀熙表示，如果要從重症清零正式進入動態清零，台灣每週確診數除了應落在 位個案，還得有效匡列、採檢，阻止小型的群聚感染疫情擴大，未來這2個月就有機會可以創造0確診。 萬一疫苗施打速率不夠快，若NPI（非藥物介入措施）又受到影響，一旦群聚感染增多就以重症清零為目標壓制疫情，再變成小群聚感染的動態清零，這是目前應採取的台灣模式。
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這次防疫充分運用智慧科技防疫（英语：Use and development of software for COVID-19 pandemic mitigation），由行政院透過個人可識別資訊整合各部會資料庫[352]，建置出「智慧防疫系統」[353]。 全民健康保險卡及雲端系統則成為防疫網絡的關鍵基礎，在口罩分配、民眾就醫紀錄、檢疫隔離與返臺資訊等面向發揮重要功能[355]。 中央流行疫情指揮中心會經由疫情調查追蹤與確診案例密切接觸者，匡列可能範圍[309]。
中華民國副總統陳建仁也曾參與英國國會下議院聽證會，及接受日本產業經濟新聞社、英國廣播公司等訪問[516]。 外交部和衛生福利部先後建置「因應武漢肺炎國際分享專區」及「COVID-19臺灣防疫關鍵決策網」，整合中央政府與地方政府各項防疫過程[517]。 為了避免大量病患湧入癱瘓醫療體系，衛生福利部規劃四階段醫療整備及應變策略，並以監測系統協助重要決策[319]。 其中在疫情升高後，醫療院所會實行分艙分流、輕重分級制度[102]，將醫療資源留給重症患者（英語：Impact of the COVID-19 pandemic on ICU capacity）[320]。 其中負壓隔離病房便用於收治疑似病例[321]，不過當前部分病房需用於收治肺結核等隔離病患[322]。 衛生福利部並利用在各地區171家急救責任醫院設定獨立專責隔離病房，將具有風險的病患就地收治於同一區[323]。
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6月17日，衛福部食藥署召開專家會議，核准莫德納疫苗用於6個月至5歲兒童的基礎接種，施打兩劑，每劑0.25 ml(含25微克的mRNA)，施打間隔28天[192]。 並核准Novavax疫苗專案輸入，適用於18歲以上成人主動免疫接種以預防COVID-19，用法用量為施打兩劑，每劑0.5毫升(含5微克的SARS-CoV-2棘蛋白)，兩劑施打間隔3週[193]。 4月21日，指揮中心估染疫率約萬分之17，並表示若染疫率達15%至20%，就是實質「與病毒共存」，目前政策以減災為目標，重點在疫苗、藥物與輕重症分流[175]。
3月17日，中央流行疫情指揮中心將全球各國（除第二、三級國家與地區之外）的旅遊疫情警示升為第一級（一級 一般措施）；歐洲四十國、中東十六國與一地區、北非五國及中亞九國[註 8]的旅遊疫情警示升為第三級（三級 不宜前往）。 從第三級國家、地區入境者應居家檢疫14天，外國無住所旅客可至集中檢疫所付費居住；從其餘國家入境者應落實14天自主健康管理[132]。 非必要前往旅遊疫情建議等級第三級等國家或地區，返台後接受隔離或檢疫者，不得領取補償，並加徵必要之費用，費用將另外公布。
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每年農曆3月期間，臺灣會舉辦大甲媽祖遶境進香、白沙屯媽祖進香等宗教儀式[438][439][440]。 內政部對此與各地宗教團體溝通，多數宗教團體都願意因應疫情停辦或暫緩活動[439][441][442]。 在疫情控制得當後，隨著「防疫新生活運動」鬆綁各項活動，大甲鎮瀾宮[443]、白沙屯拱天宮等重啟媽祖繞境進香[439][444]。
他們認為，在沒有特效藥和疫苗的情況下，為了避免新冠肺炎擠兌重症監護能力，我們可能需要長期或者間隔性的社交隔離，直到2022年。 此外，他們還呼籲，即使在新冠肺炎被明顯消除的情況下，也應維持對新冠病毒的監測，因為2024年有可能迎來新一輪復發。 越來越多的組織和機構認為，新冠病毒未來可能想流感一樣，一段時間或是特定季節時，就會大幅傳播。
此外，滯留湖北民眾可自行返台，惟搭機時應加強防護作為，並於返台後集中檢疫14天[186]。 暫停營業之業者，經各縣市政府評估符合防疫及安全條件後，可開放營業，不受室內100人、室外500人的限制[188]。 4月23日，國際疫情持續嚴峻，為維護境內防疫安全，原本4月29日到期的「限縮兩岸航空客運直航航線」（首度延後）及4月30日到期的「全面禁止旅客來台轉機」（第二度延後）二項政策，將繼續延長執行。 4月20日，第二批第一架自中國大陸撤僑的「類包機」搭載231人抵臺，並統一送至集中檢疫所進行14天隔離[175]。
台灣旅客對旅遊十分積極，更願意花錢在旅遊上，據Klook《亞太區旅遊脈動大調查》，有45%台灣旅客表示願意花費60,000元在下次旅遊上，這個比例在亞太區旅客中僅次中國大陸（71％）和香港（64％），與新加坡旅客的預估花費相當，更超過台灣平均月薪53,900元。 Klook針對台灣、日本、韓國、泰國等亞太區12個旅遊市場的旅客進行線上調查，如何決定下次旅行地點時，有62%台灣旅客表示最重要的因素為當地「獨特體驗」，位居首位；第二名為季節限定行程，第三才是機票價格，顯示台灣旅客未來出國旅遊會更加有目的性，為了特定體驗或是季節限定活動而出發。 現階段看來，雖然很多藥物和疫苗的臨床試驗正在開展，但是非藥物干預仍然是遏制新冠病毒傳播的唯一有效手段。 疫情什麼時候趨緩2023 目前，很多國家都已經實施了社交隔離，但是這些措施實施的時間和強度還有待進一步評估。
