2021年7月8日，指揮中心評估後正式宣布全國三級警戒延長至7月26日，下午一併宣布7月12日後適度鬆綁部分措施[28]。 國內日前出現首例BA.5本土社區感染案，指揮中心公布確診的北部20多歲女性5名密切接觸者，以及個案染疫母親的7名職場接觸者的PCR檢驗報告，結果都是陰性，個案一家三口是否皆感染BA.5仍待後續病毒基因定序出爐，將是今天記者會關注焦點之一。 指揮中心社區防疫組組長莊人祥則表示，疫情讓中央及各級政府和單位都動起來，包括警察、里幹事都對檢調防疫有很大幫助。 指揮中心指揮官王必勝表示，指揮中心記者會最重要的是將正確資訊傳遞民眾，特別感謝記者媒體、手語老師等團隊，「成立3年多，時間長、事情多、責任重，很辛苦，但在百年大疫時刻，替民眾服務很光榮」。 2022年2月24日，指揮中心指揮官陳時中宣布，國內邁入「經濟防疫新模式」，自3月1日起取消警戒分級改為每月檢討防疫措施[5]。 警務人員方面，每個指揮及控制中心均由一名警司擔任指揮官，並由兩名高級督察輔助；每一個分台均有一名警長擔任分台台長，及一名通訊員共同工作。
與生物病原災害中央災害應變中心、反生物恐怖攻擊指揮中心及中央緊急醫療災難應變中心等4個任務編組相互結合，同屬國家衛生指揮中心的一環，依疫情及災變需求而開設相對應的指揮應變中心。 指揮中心指揮官2023 2021年後，台灣爆發三次棘手群聚感染事件，包含苗栗京元電子移工群聚[18][19]、屏東Delta變異株病毒[20]及台北市環南市場專案[21][22]，王必勝皆代表衛福部站上第一線、開設前進指揮所、擔任調度資源的疫情指揮官。 目前並無報載王在這些前進指揮所的任何決策，或是實質接替地方政府哪些職掌。
指揮中心指揮官: 國家衛生指揮中心中央流行疫情指揮中心
考上台北醫學院（現為台北醫學大學）醫學系，王必勝特別選修彭瑞鵬開設的「呼吸系統」課程。 其中，智慧手機使用的記憶體晶片投資年減幅高達44%，電腦和資料中心使用的運算用半導體投資也減少14%。 不少半導體廠，特別是成熟製程相關廠商都已經下修今年資本支出規畫，其中，8吋晶圓代工廠世界先進調降今年資本支出至約略低於百億元，較2022年的194億元減少逾48%。 台積電先前提到，考量市場短期不確定性，將繼續審慎管理業務，並適時調整和緊縮資本支出。
2021年中華民國全國疫情第三級警戒，簡稱2021年全臺三級警戒，是中華民國在2021年因應嚴重特殊傳染性肺炎（COVID-19）疫情的管制措施。 5月15日，中華民國行政院臨時召開記者會，行政院院長蘇貞昌、衛生福利部部長兼中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中、內政部部長徐國勇、經濟部部長王美花、行政院發言人羅秉成共同宣布，臺北都會區（臺北市、新北市）提升疫情警戒至第三級至5月28日。 5月19日，中央流行疫情指揮中心宣佈，因臺灣本土疫情持續嚴峻，將第三級防疫警戒範圍擴大至全國、至5月28日[1][2]。
指揮中心指揮官: 指揮及控制中心
中央疫情指揮中心設置的法源依據自《傳染病防治法》第17條第2項，由中央衛生主管機關衛生福利部及其下設的疾病管制署，研判國內、外流行疫情嚴重程度，認有必要時，得提具體防疫動員建議，報請行政院同意成立開設，並指派指揮官[註 1]。 王必勝（1968年11月7日—），臺北市人，臺灣胸腔科醫師，現為衛生福利部政務次長、公立醫院協會理事長[3][4][5]。 2021年COVID-19疫情期間，多次擔任第一線群聚感染的疫情指揮官[6][7]，2022年7月18日接任衛生福利部政務次長[8]，曾兼任中央流行疫情指揮中心指揮官[9]。 行政院長陳建仁今25日聽取指揮中心簡報後同意5月1日起「嚴重特殊傳染性肺炎COVID-19」由第五類降級為第四類法定傳染病。 而指揮中心指揮官王必勝也於下午召開記者會宣布，從2020年1月20日成立運作至4月30日，維持長達1192天的疫情指揮中心也將隨之退場，於同日一併解編、正式走入歷史，並公布後續4大工作重點。 羅發言人又指出，蘇院長考量本土疫情雖已逐漸趨緩，但因全球疫情有再升溫的跡象，針對未來變種病毒的挑戰，國內各項防疫措施的調整作為，都必須要有迅速的因應能力與高度的執行能力，因此蘇院長決定由原醫福會王必勝執行長，升任衛生福利部政務次長，同時指派其兼任中央流行疫情指揮中心指揮官乙職。
2022年7月16日，由新任衛福部政務次長王必勝接替前衛福部部長陳時中擔任疫情中心指揮官一職。 指揮中心指揮官 指揮中心指出，在解編後，將持續透過衛福部之「COVID-19防治聯繫會報」，強化相關單位溝通協調，定期盤點醫療及防疫物資整備情形，以利疫情變化或新興變異株出現時之即時應變。 中央流行疫情指揮中心自2005年迄今已開設9次，包括登革熱、腸病毒、H1N1 指揮中心指揮官2023 、H5N6、H7N9、狂犬病、茲卡病毒和嚴重特殊傳染性肺炎。
指揮中心指揮官: 疫情指揮官交接 王必勝首度主持下午記者會
現代軍隊中，指揮官受到軍法的拘束，他必需肩負對這個組織的責任，負責其部屬的安危。 但在這個編制中，他擁有最高的決定權，能夠對其部屬下達命令，要求他們執行。 指揮中心指揮官 在美國通常一個連的隊長、連長就可稱為指揮官，在英國、加拿大和澳大利亞就是團營級別，大約是中校（Lieutenant colonel）或稱為the Colonel。 在中華民國國軍，指揮官通常是指有統帥部隊權及命令指揮權的部隊長官，狹義的指揮官則是「指揮部」的主官。
由於新冠疫情正式從第五類傳染病改為第四類，5月1日指揮中心將正式解編，今（27）日進行最終場「防疫路上，感謝有您」記者會，前疫情指揮中心指揮官陳時中、防疫顧問張上淳、衛福部長薛瑞元等人均有到場。 2021年5月25日下午，中央流行疫情指揮中心表示，全國三級警戒延長至6月14日，各級學校同步停止到校上課[25]。 2021年5月19日下午，中央流行疫情指揮中心表示即日起至2021年5月28日，提升全國疫情警戒至第三級[21][24]。 2020年4月6日，中央流行疫情指揮中心訂定〈「COVID‐19（武漢肺炎）」阻絕社區傳染策略〉，將境外移入後之社區感染管制階段分為「第一級 過渡期」、「第二級 警戒期」、「第三級 指揮中心指揮官 管制期」[14]。
指揮中心指揮官: 一、法規檢討－修訂「傳染病防治法」
指揮及控制中心為警務處架構轄屬唯一一個在編制上文職人員比較警務人員為多的部門，以及唯一一個由文職人員擔任主管的行動部門。 自殺危機處理訓練工作坊由香港撒瑪利亞防止自殺會籌辦，由導師教授自殺危機處理及接聽情緒失控者來電等技巧，透過分組活動、個案分享及角色扮演等，讓人員嘗試了解求助者的情緒，從而提升在聆聽及接聽來電時等技巧；與此同時，學習情緒急救、聆聽及與求助者建立關係的重要性[2]。 當時指揮中心提醒，外出時有飲食需求者，得在與不特定對象保持社交距離或有適當阻隔裝置之情形下，於飲食期間暫時取下口罩。
行政院發言人羅秉成今（15）日召開記者會，宣布衛生福利部部長一職由現任衛福部政務次長薛瑞元升任，原政務次長一職由衛福部醫福會王必勝執行長升任，並指派其同時兼任中央流行疫情指揮中心指揮官，李麗芬政務次長則留任原職。 另外，行政院也特別聘請中央流行疫情指揮中心專家會議召集人張上淳教授，擔任行政院首席防疫顧問，今後與新任衛福部長、新任防疫指揮官，共同出席行政院各項重要防疫會議。 指揮中心指揮官 蘇貞昌院長希望此次人事調整，能借重渠等豐富經驗和專業知識，領導衛福部和指揮中心同仁無縫接軌，持續執行政府各項重大政策及防疫工作，守護國人健康安全。 2020年1月20日，因應國際已有多起嚴重特殊傳染性肺炎案例，國家衛生指揮中心針對該疾病開設「嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心」，由疾管署署長周志浩擔任指揮官。 1月23日，行政院將該指揮中心提升為二級開設，指揮官改由時任衛生福利部部長陳時中擔任，副指揮官由時任內政部政務次長陳宗彥擔任。
指揮中心指揮官: 中華民國全國疫情第三級警戒
持續儲備及提供各年齡層公費COVID-19疫苗接種；隨時參考最新實證及各國接種建議，提報ACIP專家會議討論後續接種計畫。 6月7日，疫情記者會從每天舉辦改為一週一次，訂於每週三下午2時舉行[3]。 指揮中心指揮官 羅發言人指出，至於李麗芬次長因政務次長一職而隨同陳時中部長請辭，蘇院長認為李次長就任以來，襄助推動衛福部相關政策，表現稱職，適才適所，因此決定請李麗芬次長留任原政務次長一職。
- 2021年1月21日，中央疫情指揮中心針對境外移入後之本土疫情訂定公告《疫情警戒標準及因應事項》，將疫情警戒狀態分為分為第一、二、三、四級，數字愈高管制措施愈嚴格[15]。
- 2003年，SARS疫情期間，臺北市立關渡醫院爆發群聚感染，隨著彭瑞鵬臨危受命擔任院長，王必勝被彭瑞鵬指派負責行政管理，在此期間王必勝展現出溝通能力，感染事件也得以順利落幕。
- 指揮中心指出，在解編後，將持續透過衛福部之「COVID-19防治聯繫會報」，強化相關單位溝通協調，定期盤點醫療及防疫物資整備情形，以利疫情變化或新興變異株出現時之即時應變。
- （二）指揮中心指揮官統一指揮、督導及協調各級政府機關、公營事業及民間組織執行防疫工作。
- 中央疫情指揮中心設置的法源依據自《傳染病防治法》第17條第2項，由中央衛生主管機關衛生福利部及其下設的疾病管制署，研判國內、外流行疫情嚴重程度，認有必要時，得提具體防疫動員建議，報請行政院同意成立開設，並指派指揮官[註 1]。
5月1日起，新冠疫情降為第四類傳染病，同時也將取消住宿式長照機構、住宿式精神復健機構、精神護理之家及榮譽國民之家定期快篩措施；一般護理之家及老人福利機構服務對象維持快篩頻率為每週一次，定期篩檢措施則至5月31日止。 自此起，王必勝逐漸從醫療單一病患轉為掌控全局，先後任職北榮醫療品質管理中心、醫務企管部、部立金門醫院院長[11][12]。 外媒統計，台積電（2330）、三星、英特爾在內的全球十大半導體廠今年度投資將出現四年來首次衰退，且降幅是十年來最大，凸顯疫情紅利完全退散後，半導體景氣快速降溫，整體庫存調整狀況不如預期，導致大廠普遍對投資持謹慎態度。 指揮官（英語：commanding officer，縮寫為CO），在軍隊編制中，擁有指揮權的軍官。
