COVID-19（武漢肺炎）疫情發展瞬息萬變，《報導者》串接即時更新的病例資料庫，以多媒體地圖、圖表解釋疫情最新發展，更看見台灣本土防疫和科研進展。 陳世英也提醒，國家要檢視給予醫療院所的人力資源夠不夠，例如分配到照顧COVID-19病患的醫師，能不能只專責照顧就好，國家和社會是不是給予足夠的支持。 第一起院內感染個案發生於去年2月29日，一名50多歲婦人（案34）住進林口長庚醫院後，傳給4名院內人士，包含1名清潔工、3名醫護人員；擴散至婦人的女兒、兒子、同病房不同病室的陪病家屬、已出院病人，也陸續感染。 黃玉成表示，本土被感染的很多都是入境確診者的家屬，重症仍以抵抗力較差的年長者較多，至於男女比例的差異，原因無法斷定，要回到個案去研究。 首先，在這一波本土疫情爆發之前，和世界很多其他地方相比，台灣是相對安全的，本土感染機率非常低，很多人不覺得有必要接種疫苗，至少在疫苗生產數量不足，或其他地方更需要疫苗的時候，「台灣不需要跟別人搶」。 新冠病毒一開始在武漢出現的時候，台灣立刻就關閉了邊界，任何入境者都需要經過嚴格的隔離和篩檢措施，到如今入境隔離篩檢措施依然存在。
2021年4月20日，中華航空發生機師確診案例，員工防疫宿舍「諾富特華航桃園機場飯店」出現群聚感染，最終累計44例[84][86][93]。 2021年1月12日，衛生福利部桃園醫院爆發群聚感染事件，一度進入封鎖醫院的階段，最終累計21例[86][87][88]。 2月21日，在鑽石公主號郵輪發生群聚感染事件後，臺灣以包機方式接回19名臺灣籍旅客，進行14天隔離檢疫[54]。
台灣確診: 視頻, 台灣疫情：40萬劑AZ疫苗緊急運抵台灣 但有市民拒絶接種稱「我不想當白老鼠」
目前所有東南亞移工，包含印尼、菲律賓、泰國、越南，都須在14天檢疫期滿後採檢。 台灣2300多萬人口卻只有三十萬劑疫苗，而自美採購的約500萬劑莫德納疫苗，還未進入台灣，目前台灣政府已宣佈暫停「自費疫苗接種」，以因應醫療資源及人力分配。 其次，新冠疫苗的安全性讓台灣許多人感覺到疑慮，尤其是牛津/阿斯利康疫苗有少數接種者出現血栓症狀甚至死亡的案例，而台灣目前主要到貨的就是牛津/阿斯利康疫苗。 台灣疫情一發不可收拾的另一個原因是，和其他國家相比，台灣的新冠疫苗接種率非常低，這裏有幾個層面的因素。 經過檢疫後發現，華航諾富特群聚感染的新冠病毒是英國變異毒株B.1.1.7，而後來的萬華茶室群聚和多個地方衍生感染的病毒定序也與之相同。
在這期間，衛生福利部還特別委託公共衛生學會展開「防疫新生活健康行為監測研究計劃」，希望藉由公共衛生專業了解民眾的健康行為[304][541]。 其中在疫情升高後，醫療院所會實行分艙分流、輕重分級制度[102]，將醫療資源留給重症患者（英語：Impact of the COVID-19 pandemic on ICU capacity）[320]。 衛生福利部並利用在各地區171家急救責任醫院設定獨立專責隔離病房，將具有風險的病患就地收治於同一區[323]。 衛生福利部還在臺灣各縣市共設定22個專責醫院，必要時可以清空醫院收治患者[324]。 各地區應變醫院則透過過往經驗及整備表單，迅速自我檢查及整備完成（英語：Impact of the COVID-19 台灣確診2023 pandemic on hospitals）[325]。
台灣確診: 【今防疫】COVID-19 台灣疫情即時新聞大數據
國內疫情降溫，中央流行疫情指揮中心日前宣布鬆綁多項防疫措施，昨(3)日更宣布11月14日起確診者居家照護縮短至5天，隔離期若快篩陰性可以提前解除為自主健康管理，因此稱為「5＋n」措施，不過現行隔離制度仍為「7＋7」。 這次防疫充分運用智慧科技防疫（英语：Use and development of software for COVID-19 台灣確診 pandemic mitigation），由行政院透過個人可識別資訊整合各部會資料庫[352]，建置出「智慧防疫系統」[353]。 同時行政院還成立「防疫大數據小組」，透過大數據、人工智慧、資料分析協助疫情調查與流行病學分析[354]。 全民健康保險卡及雲端系統則成為防疫網絡的關鍵基礎，在口罩分配、民眾就醫紀錄、檢疫隔離與返臺資訊等面向發揮重要功能[355]。
根據最新基因定序，桃園舞蹈老師和大潭電廠群聚序列完全相同，顯示桃竹地區可能有潛在傳播鏈。 個案分佈為新北市52例，基隆市37例，桃園市22例，臺北市18例，高雄市9例，宜蘭縣6例，花蓮縣5例，彰化縣3例，新竹縣及新竹市各2例，金門縣、台東縣、台中市及屏東縣各1例。 羅一鈞說，在基因定序結果出爐前，曾推測可能與其他本土傳播鏈有關，但目前看來和桃園的群聚關聯性較大，仍須持續溯源、疫調，釐清可能感染途徑，但至少排除與亞東醫院或者先前礁溪長榮、雙北房仲案的關聯。 新增個案是染疫妹妹的男友，先前這名男友的媽媽也已確診，這名媽媽Ct值從一採34.3，二採降至17，代表病毒量持續增加，顯示可能才剛剛染疫。 指揮中心指揮官陳時中今天說，國內疫情大多為桃機、高雄港群聚延伸，跨縣市家族群聚因足跡多，也是關注重點；另板橋家庭群聚檢出與桃機相同病毒株，感染途徑待釐清。
台灣確診: 肺炎疫情：台灣防疫面臨最大危機 桃園醫院群聚感染考驗應對措施
指揮中心在2020年因為擔心偽陽性造成恐慌及拖累醫療資源、以及偽陰性造成感染者未依規定隔離，一直強烈反對廣篩以及入境普篩[464]，並在2019冠狀病毒病彰化篩檢爭議事件中處罰自行篩檢的單位[465][466][467][468][469]。 活動期間將透過與各地方政府共同推動，由各縣市安排/指定合約醫療院所提供接種服務，並運用增設疫苗診次及設置社區接種站等方式，增進民眾接種可近性[231]。 從5月15日起，台灣每天都錄得超過100宗本地確診個案，台灣疫情指揮中心最新公布數據顯示，周日（5月30日）單日新增355本土確診病例，包括校正回歸本土個案89例，新增11例死亡。 活動期間將透過與各地方政府共同推動，由各縣市安排/指定合約醫療院所提供接種服務，並運用增設疫苗診次及設定社區接種站等方式，增進民眾接種可近性[231]。 5月12日，正式實施修訂「2019年冠狀病毒病」定義，新增「居家隔離」及「自主防疫」或「居家檢疫」期間使用「家用快篩」檢測陽性，經醫事人員確認為確診條件[183][184]。
其後民眾大多加強落實量測體溫、配戴口罩、保持清潔、保持社交社交距離等，公共場所和業者亦提供消毒搓手液及裝置、設定隔板、出入實名制/連名制登記、人流管制及環境消毒等防疫措施[423]。 由於禁止旅客入境及居家工作模式，大眾運輸（英語：Impact of the COVID-19 pandemic on public transport）站點的搭乘人數大幅度減少[397][424]，不過公園造訪率則增加[425]。 惟特殊情形(如第1劑接種後出現嚴重不良反應、指揮中心評估疫苗供應情形等)下，可以不同廠牌疫苗完成2劑接種[191]。 指揮中心表示，今日新增之132例本土病例，為62例男性、70例女性，年齡介於未滿5歲至80多歲，發病日介於今(2021)年6月1日至6月14日。 台灣確診 個案分佈以新北市65例最多，其次為臺北市26例，苗栗縣18例，桃園市12例，基隆市3例，臺南市、臺中市及花蓮縣各2例，嘉義縣及彰化縣各1例。 其中雙北地區以外縣市41例中，33例為已知感染源、6例關聯不明、2例調查中；相關疫情調查持續進行中。
台灣確診: 流行疾病
2020年1月，隨著疫情擴大，疾病管制署先是規定返回臺灣就讀的中國大陸學生配合自主健康管理，後來全面暫緩中國大陸學生入境，從而引發爭議[364][365]。 原本各級學校預計在2月10日結束寒假，中央流行疫情指揮中心決定普通型高級中等學校和技術型高級中等學校以下學校延至2月25日開學，108學年度第二學期改為2020年2月25日至7月14日[366]。 大專院校隨後延至2月25日後開學，7月的大學入學指定科目考試亦首度延期[367]。
在疫情控制得當後，隨著「防疫新生活運動」鬆綁各項活動，大甲鎮瀾宮[443]、白沙屯拱天宮等重啟媽祖繞境進香[439][444]。 其他像是嘉義市輪流普渡等、原住民族文化祭典等傳統活動也都受到疫情影響[445][446]，不過臺灣在疫情期間亦曾舉辦驕傲遊行（英语：Impact of the COVID-19 pandemic on the LGBT community）[447]。 在進入三級防疫警戒後，臺灣的大眾運輸、休閒場所等地的人流明顯下滑，不過日常採買仍維持基本人流[448]。
台灣確診: 台灣「確診致死率」真的高於全球？醫師引用國際數據提４點解讀
8月8日，「衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組」（ACIP）召開專家會議，正式宣布「6個月至5歲」（幼兒）輝瑞－BioNTech疫苗提供接種建議，以3劑基礎劑，每劑3微克(mcg)，第1劑與第2劑間隔至少4週，第2劑與第3劑間隔至少8週，並建議以同一廠牌完成應接種劑次[207]。 5月26日，正式實施修訂「2019年冠狀病毒病」定義，民眾使用家用抗原快篩試劑檢測結果陽性，不分年齡及族群，經醫事人員確認，或由醫事人員執行抗原快篩結果陽性者，即可研判為確定病例[190]。 4月20日，「衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組」（ACIP）將「6至11歲」（兒童）接種莫德納疫苗兩劑間隔延長至12週[171]。
在疫苗接種部分，臺灣將優先建議接種疫苗的族群分為九類，涵蓋臺灣人口的60%[337]。 隨著防疫物資需求（英语：Shortages related to the COVID-19 pandemic）上升，食品藥物管理署展開盤點整備，積極管控數量狀況[274]。 紡織產業綜合研究所緊急成立口罩戰情室，調查產能、協助生產管理及盤點出貨[275]。 面對臺灣長期向中國大陸進口口罩、民眾搶購動力顯著上升，行政院決定禁止（英语：Face masks during the COVID-19 pandemic）出口外科口罩和N95口罩[276]，並委託口罩廠商趕工提升產能[277]。 在各地出現口罩搶購潮且引發民眾不滿後，中央流行疫情指揮中心宣布全面徵用工廠生產的一般醫用口罩及外科手術口罩[278][279]，提供民生、儲備、醫療或公務防疫等需求[280]。
台灣確診: 嚴重特殊傳染性肺炎臺灣疫情時間線 (2021年)
而林氏璧也進一步解釋，他認為全世界新冠確診者致死率，之所以在去年2020年的年中後逐漸下降。 原因則可能和各國醫療上的進步，譬如，知道重症者治療上可先使用類固醇、知道插管的時機，醫療上比起第一波疫情較有餘裕等因素相關。 案36928於今年4月18日出現咳嗽、發燒等症狀住院採檢，4月19日確診，具慢性及癌症病史，使用瑞德西韋等藥物及呼吸器治療，於4月22日死亡。
4月1日，指揮中心制定兩階段「社交距離注意事項」，在兼顧民眾合理權益，並顧及境內防疫安全等雙重前提下，降低社區感染風險，分階段鼓勵或強制保持社交距離[71]。 指揮中心統計，自2020年起國內COVID-19累計10,069,539例確診、18,010例死亡。 指揮中心指出，近期確診個案解隔離情形，5月11日至6月13日累計公布11,722位確診個案中，已有6,188人解除隔離，解隔離人數達確診人數52.8%。
台灣確診: 出現病例
12月9日，台灣間隔34天後，再度出現本土個案，為中研院一名女研究員，她在實驗過程中不慎感染[136]。 9月18日，指揮中心宣布，考量目前國內口罩產量已大幅提升，足夠供應每位國人所需，且有多元購買口罩管道，民眾透過實名制通路取得口罩的需求已大幅下降，因此「口罩實名制」網路/超商販售通路，將運作至第44輪後暫停服務。 藥局通路及無健保特約藥局的偏鄉衛生所，則仍持續維持實名制口罩販售服務[119]。 5月22日，隨著各地醫療院所和社區篩檢站出現人潮、醫療資源與人力出現排擠效應、出現院內感染情況，逐步執行「清零計畫」、部署基層醫師至社區篩檢站、分散採檢人潮等[98][102][103]。 同時檢驗實驗室無法處理大量檢體，未能優先採檢確診接觸者[104]，因行政流程需「校正回歸」數據[105][106][107]。 5月15日，宣布臺北市、新北市進入第三級警戒[95][96]，並宣布暫停自費接種「COVID-19疫苗」，原已預約者仍可接種[97]。
英國、南非、史瓦帝尼旅遊史者，因入台病例被檢出變種病毒列為入境普篩，入境及檢疫期滿需強制篩檢2次。 國民黨不少民意代表將矛頭指向中央疫情指揮中心的指揮官衛福部長陳時中，指責他身為防疫總指揮應該為此負最大責任。 台灣本土疫情蔓延，反對黨也抓住這個機會趁勢猛攻，過去一年來執政的民進黨由於防疫成功一直處於民意支持高點，現在一下子就幾乎快被反對黨「打趴」。 事實上，許多國家在新冠疫情爆發之初都有過所謂的校正回歸的概念，因為疑似病例突增造成檢測量能不足，例如英國也曾經有平日確診數高，周末確診數低的情況，時間一旦拉長，再將統計數改為「過去7日平均確診數」的話，就不會再有校正回歸的問題。 台灣政府一直到多種新冠疫苗陸續受到歐美國家的批准認證之後才開始向廠商洽購，而這個時候大多數的頭幾批的生產量早已經被其他國家預訂一空，而這些國家在疫苗研發期間可能早就已經投資研發經費，因此台灣拿到的疫苗數量非常少。
台灣確診: 本土增4萬 新北破萬、6縣市破千
社會工作者則為遊民等弱勢族群進行訪視關懷、提供防疫物資與衛生教育宣導，並到社區及相關社會福利機構服務[430]。 隨著疫情趨緩，社會工作者則依規定審核補償和紓困金並撥付給民眾，並針對生活困苦的家庭提供關懷輔導服務[431]。 台灣確診 而在疫情期間，隨著臺灣的「合法移工」人數下降、「非法移工」人數持續上升，許多僱用「家務移工」照顧長輩的雙薪白領家庭受到影響[432]。 相對於醫院內部照顧員和看護不願接案，許多家屬則必須自己輪班進入醫院陪病[433]。 不過在酒店、茶室、舞廳、三溫暖等八大行業業者數次被要求停止營業後，讓部分相關女性轉入地下工作[434][435][436][437]。 在疫情初期，近十臺電視頻道、YouTube、網路媒體便重複播放防疫宣導廣告（英語：Public service announcement），從各層面教育民眾一起防範疫情[418]。
衛生局表示，登革熱從發病前一天到後五天都有傳染力，會透過斑蚊叮咬而擴散登革熱病毒，「隱藏」在社區內的病患若能快速被通報，有助於衛生單位即時防治，就能避免疫情快速擴散。 屏東縣截至20日累計21例登革熱本土確診病例，其中萬丹鄉17例、潮州鎮2例、屏東市及竹田鄉各1例，屏東縣政府持續加強查核高風險區域及髒亂點清除，擴大社區動員環境整頓，自8月16日起無新增病例，但風險尚未解除，仍須持續監測。 5月22日，台灣本土確診病例單日新增321例（校正後為473例），確診病例新增2例死亡，並公布5月16日至21日經校正回歸新增本土確診400例[79]，這是指揮中心首次以「校正回歸」新增之前數日的本土確診病例數[80]。 2020年5月15日，立法院三讀通過《公共衛生師法》，明定公共衛生師的執業範圍、場域以及應考資格，而這也是亞洲第一部《公共衛生師法》[304][539]。 其中受到嚴重特殊傳染性肺炎疫情的影響，《公共衛生師法》的確立公共衛生師平時分別在公家機關、私人企業或自行開業來規劃服務，而在疫情發生或政府有特別需求時得以徵調[304][540]。
